当寺は江戸時代は「連峰山福寿院」と称していた修験の寺であったが、明治の廃仏毀釈で廃寺になり、その一部の境内の跡地に戊辰の役により荒廃し、人心が傷悴していた折、及川照龍律師（明治40年10月17日没）が末広講を結成し大本山成田山新勝寺御本尊の御分霊を明治3年に勧請し、明治21年10月28日圓養院として現本堂を建立開基されたと伝えられています。
第２世照輪師は弘敬講社を結成せられ信者の教化に尽力された。昭和9年に第３世金沢誠仁中僧正が晋山し、布教を重ねて昭和28年圓養寺と改め現在の山容に整えられた。